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注册个体工商户和注册公司的区别主要体现在以下几个方面。
1、性质不同：个体工商户不具有法人资格，而公司具有法人资格，个体工商户是自然人或以家庭为单位进行经营的商业组织形式，其经营者承担无限责任；而公司则是企业法人，其股东承担有限责任。
2、投资主体不同：个体工商户的投资主体只能是自然人，而公司的投资主体可以是自然人，也可以是法人。
3、税收不同：个体工商户的税收一般根据业主的实际情况而定，而公司的税收则根据公司的实际经营状况进行缴纳，在纳税和计税方面，两者也存在差异，个体户一般会被征收个人所得税，而公司则可能会涉及企业所得税、增值税等。
4、经营限制不同：个体工商户的经营范围相对较小，可能仅限于特定的行业或商品，而公司的经营范围则更加广泛，可以涵盖多个领域，个体户在经营时不能开设分店或注册多个营业执照，而公司则可以开设分支机构或拥有多个子公司。
注册个体工商户和注册公司各有其特点，选择哪种形式取决于具体的经营需求、投资规模、行业特点等因素，如果需要更详细的比较和咨询，建议咨询专业的法律或财务顾问。